MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.02

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018147	G	6	6	49	54	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018147	A	7	7	99	105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018147	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018147	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018147	AGC	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018147	TTCAAA	2	12	234	245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397677567
7	NC_018147	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677567
8	NC_018147	GCTG	2	8	263	270	0 %	25 %	50 %	25 %	397677567
9	NC_018147	CTG	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677567
10	NC_018147	GAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677567
11	NC_018147	AGC	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677567
12	NC_018147	CTT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677567
13	NC_018147	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677567
14	NC_018147	ATA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
15	NC_018147	TAA	2	6	468	473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677567
16	NC_018147	TCC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677567
17	NC_018147	ATTT	2	8	510	517	25 %	75 %	0 %	0 %	397677567
18	NC_018147	T	6	6	575	580	0 %	100 %	0 %	0 %	397677568
19	NC_018147	TGGC	2	8	603	610	0 %	25 %	50 %	25 %	397677568
20	NC_018147	CTT	2	6	679	684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677568
21	NC_018147	TATTCA	2	12	745	756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397677568
22	NC_018147	GT	3	6	778	783	0 %	50 %	50 %	0 %	397677568
23	NC_018147	GATG	2	8	924	931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018147	T	6	6	938	943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018147	ATGAG	2	10	1033	1042	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018147	TA	3	6	1064	1069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018147	A	6	6	1187	1192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018147	ATA	2	6	1203	1208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018147	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018147	A	6	6	1252	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018147	ATG	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018147	TA	3	6	1372	1377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018147	TGA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677569
34	NC_018147	GATATT	2	12	1847	1858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397677569
35	NC_018147	AG	3	6	2022	2027	50 %	0 %	50 %	0 %	397677569
36	NC_018147	ATA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677569
37	NC_018147	TCA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
38	NC_018147	TTG	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677569
39	NC_018147	CAGCGA	2	12	2164	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677569
40	NC_018147	TTATT	2	10	2187	2196	20 %	80 %	0 %	0 %	397677569
41	NC_018147	CTA	2	6	2274	2279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677569
42	NC_018147	CTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
43	NC_018147	GCT	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677569
44	NC_018147	TCT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018147	T	6	6	2603	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018147	TA	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018147	TTA	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018147	TA	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018147	A	8	8	2690	2697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018147	A	6	6	2704	2709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018147	TTG	2	6	2731	2736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018147	TACG	2	8	2929	2936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018147	TAT	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018147	CTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018147	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018147	A	6	6	3023	3028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018147	CTT	2	6	3088	3093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018147	AGAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018147	GGC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397677570
60	NC_018147	GGTGCC	2	12	3128	3139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397677570
61	NC_018147	ATTG	2	8	3224	3231	25 %	50 %	25 %	0 %	397677570
62	NC_018147	GTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677570
63	NC_018147	AGCT	2	8	3286	3293	25 %	25 %	25 %	25 %	397677570
64	NC_018147	T	7	7	3420	3426	0 %	100 %	0 %	0 %	397677571
65	NC_018147	TAA	2	6	3492	3497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677571
66	NC_018147	T	6	6	3511	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	397677571
67	NC_018147	GAA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
68	NC_018147	TCT	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
69	NC_018147	CAT	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
70	NC_018147	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
71	NC_018147	TCT	3	9	3604	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677571
72	NC_018147	AAG	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677571
73	NC_018147	TAC	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677571
74	NC_018147	TGT	2	6	3742	3747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677571
75	NC_018147	ATTTA	2	10	3750	3759	40 %	60 %	0 %	0 %	397677571
76	NC_018147	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677571
77	NC_018147	TA	4	8	3940	3947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018147	GTA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018147	ATA	2	6	4041	4046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018147	TGA	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018147	T	8	8	4104	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018147	AAT	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018147	T	6	6	4251	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018147	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677572
85	NC_018147	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677572
86	NC_018147	TAGA	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	397677572
87	NC_018147	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677572
88	NC_018147	CGA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677572
89	NC_018147	T	6	6	4661	4666	0 %	100 %	0 %	0 %	397677573
90	NC_018147	CTGTT	2	10	4691	4700	0 %	60 %	20 %	20 %	397677573
91	NC_018147	TCT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677573
92	NC_018147	GA	3	6	4765	4770	50 %	0 %	50 %	0 %	397677573
93	NC_018147	CTGA	2	8	4805	4812	25 %	25 %	25 %	25 %	397677574
94	NC_018147	ATT	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677574
95	NC_018147	GAA	3	9	4838	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
96	NC_018147	AAG	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677574
97	NC_018147	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
98	NC_018147	TCT	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
99	NC_018147	ATC	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677575
100	NC_018147	CGT	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
101	NC_018147	TTC	2	6	5189	5194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
102	NC_018147	TCT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677575
103	NC_018147	TGC	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
104	NC_018147	GAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
105	NC_018147	A	7	7	5424	5430	100 %	0 %	0 %	0 %	397677575
106	NC_018147	ACC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677575
107	NC_018147	GCC	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
108	NC_018147	CGA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
109	NC_018147	CCGT	2	8	5827	5834	0 %	25 %	25 %	50 %	397677575
110	NC_018147	TGG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397677575
111	NC_018147	GTC	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
112	NC_018147	TGC	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677575
113	NC_018147	TCAA	2	8	5991	5998	50 %	25 %	0 %	25 %	397677575
114	NC_018147	AGAC	2	8	6004	6011	50 %	0 %	25 %	25 %	397677575
115	NC_018147	CGC	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397677575
116	NC_018147	GGA	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
117	NC_018147	TGA	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
118	NC_018147	AGAC	2	8	6157	6164	50 %	0 %	25 %	25 %	397677575
119	NC_018147	CCT	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397677575
120	NC_018147	GA	3	6	6215	6220	50 %	0 %	50 %	0 %	397677575
121	NC_018147	CGAG	2	8	6284	6291	25 %	0 %	50 %	25 %	397677575
122	NC_018147	AAC	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677575
123	NC_018147	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
124	NC_018147	AAG	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
125	NC_018147	AGG	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677575
126	NC_018147	TTAT	2	8	6452	6459	25 %	75 %	0 %	0 %	397677575
127	NC_018147	CGA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677575
128	NC_018147	AGA	3	9	6491	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397677575
129	NC_018147	ACTGC	2	10	6505	6514	20 %	20 %	20 %	40 %	397677575
130	NC_018147	GCAG	2	8	6525	6532	25 %	0 %	50 %	25 %	397677575
131	NC_018147	GTT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677575
132	NC_018147	ACCTGA	2	12	6557	6568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397677575
133	NC_018147	A	7	7	6578	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	397677575
134	NC_018147	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677575
135	NC_018147	TC	3	6	6765	6770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018147	GCT	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018147	G	6	6	6821	6826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018147	ATT	2	6	6880	6885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018147	A	6	6	6887	6892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018147	TCC	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018147	A	6	6	6946	6951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_018147	ATC	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677581
274	NC_018147	GCA	2	6	12605	12610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677581
275	NC_018147	TA	3	6	12757	12762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018147	TTA	2	6	12805	12810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
277	NC_018147	GCGGTA	2	12	12829	12840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397677582
278	NC_018147	GCA	2	6	12870	12875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677582
279	NC_018147	CAT	2	6	12899	12904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677582
280	NC_018147	AG	3	6	12920	12925	50 %	0 %	50 %	0 %	397677582
281	NC_018147	CAA	2	6	12928	12933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677582
282	NC_018147	ATT	2	6	13041	13046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
283	NC_018147	CGCCC	2	10	13049	13058	0 %	0 %	20 %	80 %	397677582
284	NC_018147	TGC	2	6	13061	13066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
285	NC_018147	CGA	2	6	13089	13094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397677582
286	NC_018147	GCT	2	6	13140	13145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
287	NC_018147	ATT	2	6	13164	13169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397677582
288	NC_018147	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397677582
289	NC_018147	CAC	2	6	13319	13324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397677582
290	NC_018147	GCT	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677582
291	NC_018147	CAT	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397677582
292	NC_018147	TAA	2	6	13397	13402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397677582
293	NC_018147	TA	3	6	13415	13420	50 %	50 %	0 %	0 %	397677582
294	NC_018147	TA	3	6	13431	13436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018147	AACC	2	8	13468	13475	50 %	0 %	0 %	50 %	397677583
296	NC_018147	GCT	2	6	13482	13487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677583
297	NC_018147	AAC	2	6	13664	13669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397677583
298	NC_018147	AGGC	2	8	13687	13694	25 %	0 %	50 %	25 %	397677583
299	NC_018147	TA	3	6	13760	13765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_018147	TTGAT	2	10	13832	13841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
301	NC_018147	GAG	2	6	13867	13872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018147	TGA	2	6	13963	13968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677584
303	NC_018147	CGT	2	6	13970	13975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677584
304	NC_018147	GT	3	6	13974	13979	0 %	50 %	50 %	0 %	397677584
305	NC_018147	CA	3	6	14046	14051	50 %	0 %	0 %	50 %	397677584
306	NC_018147	ATG	2	6	14105	14110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397677584
307	NC_018147	TGAT	2	8	14151	14158	25 %	50 %	25 %	0 %	397677584
308	NC_018147	A	6	6	14203	14208	100 %	0 %	0 %	0 %	397677584
309	NC_018147	CTT	2	6	14298	14303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677585
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311	NC_018147	AG	3	6	14413	14418	50 %	0 %	50 %	0 %	397677585
312	NC_018147	GGA	2	6	14424	14429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397677585
313	NC_018147	TCT	3	9	14588	14596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397677585
314	NC_018147	TGC	2	6	14610	14615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397677585
315	NC_018147	TAT	2	6	14745	14750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_018147	GACT	2	8	14763	14770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
317	NC_018147	TGGG	2	8	14898	14905	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
318	NC_018147	AAT	2	6	14910	14915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_018147	TTA	2	6	14917	14922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.